平背麝香龟体长:7.6-11.4cm,头和颈部稍带绿色,并覆盖着深色的网状图案,下颚有一对触须。四肢有脚蹼,雄性尾巴粗而长,颜色一般为褐色。背甲非常的平坦,两侧的斜坡形成了一个大于100度的角度。幼体时,斜面的角度与高度的比率大约为9.5:1。
背部中央有一条比较钝的、不太明显的脊椎骨。背甲前端两侧的缘盾略微呈锯齿状,每块脊椎盾甲都与后方盾甲前端交迭,第1块脊椎盾甲比较的长,从不于第2块缘盾相接触,另外4块脊椎盾甲的宽度大于其自身的长度,第5块则向后方扩展。背甲的颜色为黄褐色和咖啡色,伴有黑色或咖啡色的斑点与条纹。

盾甲间有明显的黑色交界线,腹甲为粉色和黄褐色,有*的一块喉盾。在腹盾的前端是一块不太清晰的铰链盖,腹甲大小排列的顺序为:腹盾>胸盾>臀盾>肋盾>喉盾。头部的大小适中,有不完全类似于钩状的上颚,在橄榄色头背部是完美的黑色网状条纹和斑点,在成体后有适度的扩大。
某些成体的平背麝香龟从鼻孔处到眼眶有着黄色的条纹,颈部有纵向的斑纹图案,条纹比较窄,不如虎纹麝香龟那么明显。
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