首先可以看它们的颈部。若是颈部有黄色或者红色的条纹,那么就是火焰龟;没有条纹、颈部非常黑的或者条纹的颜色是黄色和绿色相间的,则是巴西龟。
火焰龟和巴西龟的背甲差异是比较大的。火焰龟的背部一开始是黄色和绿色相间,之后一般会变为黑色和红色相间,这也是火焰龟得名的原因。在变色之后,火焰龟和巴西龟的差别是比较大了,因为巴西龟的背壳一般都是绿色的。

火焰龟和巴西龟的腹部也是有区别的。火焰龟腹部上会有一些图案,不过这些图案的大小以及形状都是不固定的,看起来没有规则。但巴西龟腹部的斑块是比较有规则的,一般会是左右对称的一些图形,圆形、棒形或者蝴蝶形都是有可能的。
再者还可以看它们的头部。若是头部比较宽大的,则是巴西龟;头部比较窄的则是火焰龟,不过这需要在它们体型差不多的基础上才可以比较。另外,火焰龟的头部上有黄色的花纹,巴西龟的头上也可能有花纹,但颜色不同,一般是橘色或红色。
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