三湖慈鲷的品种很多，不同品种的繁殖频率是不同的。而且，养殖环境是否适宜也会影响到繁殖的频率。一般情况下，它们每年能够繁殖两次，也有少数品种每年仅繁殖一次。但还有一些品种繁殖次数较多，在适宜的环境中每年能够繁殖4次以上。

口孵繁殖：同一鱼缸中的公鱼和母鱼看对眼以后，会一起游到一个相对偏僻的角落。然后，母鱼会将卵产在底砂上面，公鱼受精，母鱼再将受精卵含入口中保护。再之后，口中含有鱼卵的母鱼会远离鱼群，并且不会进食。等大约15天左右，小鱼就可以孵化出来。在孵化期要注意，不要惊吓母鱼，以免它吞卵或者弃卵。如果比较有经验，可以在孵化期抠卵，将鱼卵从母鱼口中取出来，单独养殖孵化。

基质繁殖：公鱼和母鱼会在鱼缸的底部的岩洞或者贝壳里面产卵。有的时候还会做一个沙窝，将卵产在沙窝里面。之后，母鱼会留在产卵的地点附近，负责照顾、孵化鱼卵。而公鱼会在产卵的地方附近游动巡逻，起到警戒、保护的作用。在孵化期间，应保持环境稳定，不要有较大的噪声或者较大的光线变化，以免吓到鱼儿。